Нужно в блоке «Информация, которую нужно обновить» выключить обновление всех полей, кроме «Группа». В результате, описания старых товаров не будут обновляться, а новые товары будут добавляться в нужные группы. Если также снять и флаг «Группа», то ничего не будет обновляться, а новые товары попадут в корневую группу.
Если вы хотите загружать на сайт только новые товары, можно сделать файл импорта, в который добавить только новые товары, а при импорте для блока «Статус товаров, которых нет в файле» установить флаг «Оставить без изменений». В результате на сайт будут загружены новые товары в корневую папку или сразу в нужные папки в зависимости от установок в блоке «Информация, которую нужно обновить».